Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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UBL4AP11441 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBL4AP11441 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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