Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF14O43557 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF14O43557 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF14O43557 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms