Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGSM2O43147 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms