Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHMP3Q9Y3E7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms