Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHF8Q9UPP1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHF8Q9UPP1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms