Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS11EQ9UL52 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms