Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms