Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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USP35Q9P2H5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP35Q9P2H5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP35Q9P2H5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP35Q9P2H5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP35Q9P2H5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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