Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms