Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLIRPQ9GZT3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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