Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZCCHC2Q9C0B9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms