Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CNTNAP3Q9BZ76 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CNTNAP3Q9BZ76 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CNTNAP3Q9BZ76 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CNTNAP3Q9BZ76 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CNTNAP3Q9BZ76 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CNTNAP3Q9BZ76 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CNTNAP3Q9BZ76 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTNAP3Q9BZ76 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTNAP3Q9BZ76 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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