Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms