Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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YIPF4Q9BSR8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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YIPF4Q9BSR8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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YIPF4Q9BSR8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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YIPF4Q9BSR8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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YIPF4Q9BSR8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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YIPF4Q9BSR8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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YIPF4Q9BSR8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
YIPF4Q9BSR8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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