Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHFRQ96EP1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms