Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRT1Q96EB6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms