Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CLDN23Q96B33 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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CLDN23Q96B33 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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CLDN23Q96B33 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CLDN23Q96B33 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CLDN23Q96B33 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN23Q96B33 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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