Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIG3Q6UXM1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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