Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL5Q6EMB2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms