Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG16L1Q676U5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms