Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms