Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ZNF239Q16600 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ZNF239Q16600 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ZNF239Q16600 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ZNF239Q16600 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ZNF239Q16600 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ZNF239Q16600 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ZNF239Q16600 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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