Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF11Q15544 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF11Q15544 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms