Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms