Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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