Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMC1AQ14683 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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