Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RASGRF1Q13972 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RASGRF1Q13972 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms