Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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DDX39BQ13838 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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