Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDH18Q13634 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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