Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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ITGB3BPQ13352 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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ITGB3BPQ13352 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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ITGB3BPQ13352 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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ITGB3BPQ13352 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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