Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms