Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLFN5Q08AF3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFN5Q08AF3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms