Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms