Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX1P78414 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX1P78414 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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