Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
UBE2NP61088 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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UBE2NP61088 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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