Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms