Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO2P25791 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms