Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGGP02679 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGGP02679 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FGGP02679 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms