Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms