Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAG9O60271 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms