Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms