Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms