Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms