Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
A4D1N5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
A4D1N5 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms