Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RABGEF1Q9UJ41 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1Q9UJ41 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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