Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC00474Q9P2X8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms