Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS1Q9NYS0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms