Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMILIN3Q9NT22 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms