Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GSDMCQ9BYG8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms