Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms